MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae R6 chromosome

Total Repeats: 7780

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003098	T	6	6	1381	1386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_003098	T	6	6	1390	1395	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_003098	T	6	6	1403	1408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_003098	A	6	6	1418	1423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_003098	TAT	2	6	1472	1477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_003098	TAT	2	6	1481	1486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_003098	ATAA	2	8	1503	1510	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_003098	GAAAA	2	10	2702	2711	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_003098	AGT	2	6	2716	2721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_003098	TTAG	2	8	2923	2930	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_003098	TGAAA	2	10	2974	2983	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_003098	TAA	2	6	4120	4125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_003098	A	7	7	4145	4151	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_003098	TCT	2	6	8272	8277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_003098	AAT	2	6	8300	8305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_003098	TAA	2	6	8315	8320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_003098	TTA	2	6	8964	8969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_003098	GA	3	6	14137	14142	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_003098	CT	3	6	14152	14157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_003098	T	6	6	14157	14162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_003098	A	8	8	14744	14751	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_003098	A	7	7	14754	14760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_003098	AGT	2	6	14769	14774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_003098	CGG	2	6	14864	14869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_003098	TGA	2	6	14922	14927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_003098	A	7	7	14927	14933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_003098	A	7	7	14938	14944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_003098	A	6	6	14958	14963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_003098	GA	3	6	15012	15017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_003098	ACA	2	6	15074	15079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_003098	GTA	2	6	15086	15091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_003098	A	7	7	15102	15108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_003098	GGC	2	6	15188	15193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_003098	AGG	2	6	15223	15228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_003098	GCTT	2	8	15230	15237	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_003098	CCTG	2	8	15278	15285	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
37	NC_003098	TGG	2	6	15407	15412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_003098	CGA	2	6	15431	15436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_003098	GCA	2	6	15505	15510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_003098	CGC	2	6	15552	15557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_003098	GTGA	2	8	15558	15565	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_003098	TGT	2	6	15591	15596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_003098	AGA	2	6	15600	15605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_003098	CAG	2	6	15674	15679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_003098	AGCG	2	8	15729	15736	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_003098	TAG	2	6	15781	15786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_003098	AT	3	6	15858	15863	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_003098	GGA	2	6	15864	15869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_003098	CT	3	6	15889	15894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_003098	GAA	2	6	16128	16133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_003098	GGT	2	6	16202	16207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_003098	GTC	2	6	16216	16221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_003098	TCGTG	2	10	16225	16234	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_003098	CAT	2	6	16284	16289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_003098	TAA	2	6	16319	16324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_003098	GGA	2	6	16328	16333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_003098	ATC	2	6	16352	16357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_003098	AC	3	6	16379	16384	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_003098	CGC	2	6	16518	16523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_003098	AC	3	6	16548	16553	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_003098	CAC	2	6	16563	16568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_003098	AGCC	2	8	16610	16617	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_003098	GAT	2	6	16633	16638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_003098	CCT	2	6	16689	16694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_003098	TAAGGA	2	12	16698	16709	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_003098	AGG	2	6	16788	16793	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_003098	GA	3	6	16826	16831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_003098	GTA	2	6	16903	16908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_003098	TAA	2	6	16910	16915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_003098	GTTAA	2	10	16946	16955	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_003098	CGA	2	6	16991	16996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_003098	ACG	2	6	17009	17014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_003098	GTAA	2	8	17032	17039	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_003098	GAT	2	6	17042	17047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_003098	GAG	2	6	17112	17117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_003098	TAG	2	6	17180	17185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_003098	GCGA	2	8	17188	17195	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_003098	AGG	2	6	17202	17207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_003098	AGA	2	6	17267	17272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_003098	AG	3	6	17295	17300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_003098	CGG	2	6	17351	17356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_003098	GGA	2	6	17383	17388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_003098	GGGAG	2	10	17464	17473	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
84	NC_003098	ACA	2	6	17501	17506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_003098	ATG	2	6	17568	17573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_003098	GGA	2	6	17701	17706	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_003098	TC	3	6	17787	17792	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_003098	ACC	2	6	17967	17972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_003098	AAT	2	6	17987	17992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_003098	AGC	2	6	18047	18052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_003098	ATTC	2	8	18054	18061	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_003098	TG	3	6	18176	18181	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_003098	GAG	2	6	18197	18202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_003098	GA	3	6	18327	18332	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_003098	ACA	2	6	18353	18358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_003098	CTAA	2	8	18408	18415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_003098	GTCT	2	8	18433	18440	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_003098	TAG	2	6	18510	18515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_003098	GA	3	6	18623	18628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_003098	CT	3	6	18739	18744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_003098	GAT	2	6	18757	18762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_003098	CGG	2	6	18848	18853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_003098	GA	3	6	18946	18951	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_003098	TAGG	2	8	19064	19071	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_003098	TAC	2	6	19118	19123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_003098	CCT	2	6	19206	19211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_003098	GGT	2	6	19342	19347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_003098	TCG	2	6	19457	19462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_003098	CGT	2	6	19537	19542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_003098	AGGGA	2	10	19675	19684	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_003098	TA	3	6	19741	19746	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_003098	GA	3	6	19761	19766	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_003098	GAAGTG	2	12	19786	19797	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_003098	ACTAAT	2	12	19816	19827	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_003098	AGT	2	6	19995	20000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_003098	GTA	2	6	20062	20067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_003098	ATG	2	6	20085	20090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_003098	T	6	6	20144	20149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_003098	TAA	3	9	20156	20164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_003098	TGA	2	6	20627	20632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_003098	TAA	2	6	20689	20694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_003098	GAA	2	6	20710	20715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_003098	GAA	2	6	21122	21127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_003098	CTTT	2	8	21158	21165	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_003098	T	6	6	21163	21168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_003098	TGA	2	6	21216	21221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_003098	ATT	2	6	21223	21228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_003098	GTG	2	6	21357	21362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_003098	TTA	2	6	21406	21411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_003098	TTG	2	6	21471	21476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_003098	GAT	2	6	21524	21529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_003098	ATT	2	6	21693	21698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_003098	AGTTGA	2	12	21714	21725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_003098	TGA	2	6	21736	21741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_003098	TGA	2	6	21794	21799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_003098	TGA	2	6	21811	21816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_003098	TTC	2	6	21817	21822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_003098	AAG	2	6	21888	21893	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_003098	T	7	7	21908	21914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_003098	ATA	2	6	21934	21939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_003098	TA	3	6	21942	21947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_003098	T	6	6	22011	22016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_003098	TTG	2	6	22070	22075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_003098	T	6	6	22122	22127	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_003098	A	6	6	22144	22149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_003098	GAT	2	6	22450	22455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_003098	T	6	6	22485	22490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_003098	TCT	2	6	22523	22528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_003098	T	6	6	22543	22548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_003098	TAA	2	6	22553	22558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_003098	ATGT	2	8	22593	22600	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_003098	AAG	2	6	23973	23978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_003098	CCT	2	6	23980	23985	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_003098	TTG	2	6	23989	23994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
155	NC_003098	CTTTT	2	10	24011	24020	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
156	NC_003098	ATA	2	6	24023	24028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_003098	T	7	7	24060	24066	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_003098	ATA	3	9	24084	24092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_003098	ATA	2	6	24620	24625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_003098	GGA	2	6	24663	24668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
161	NC_003098	CAG	2	6	24672	24677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_003098	TG	3	6	24695	24700	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
163	NC_003098	T	7	7	24704	24710	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_003098	AATA	2	8	24724	24731	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_003098	AAT	2	6	24738	24743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_003098	ATA	2	6	24756	24761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_003098	A	6	6	25759	25764	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_003098	TCT	2	6	25840	25845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_003098	AGAA	2	8	27693	27700	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
170	NC_003098	CT	3	6	28428	28433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
171	NC_003098	TTA	2	6	28438	28443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_003098	TTG	2	6	28458	28463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_003098	TGA	2	6	28479	28484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_003098	CTT	2	6	28533	28538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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177	NC_003098	GAT	2	6	29616	29621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
178	NC_003098	T	6	6	29638	29643	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_003098	AATA	2	8	29647	29654	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
180	NC_003098	TAG	2	6	29657	29662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
181	NC_003098	ATA	2	6	29699	29704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_003098	AGA	2	6	29710	29715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
183	NC_003098	TCA	2	6	29730	29735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_003098	CAT	2	6	29750	29755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_003098	TAG	2	6	29803	29808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
186	NC_003098	TTC	2	6	29862	29867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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189	NC_003098	TG	3	6	29929	29934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
190	NC_003098	TGA	2	6	29944	29949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_003098	GTT	2	6	30034	30039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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194	NC_003098	ATA	2	6	30096	30101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_003098	T	6	6	30521	30526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_003098	TTG	2	6	30569	30574	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
197	NC_003098	TGT	2	6	30595	30600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_003098	TTTAT	2	10	64522	64531	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_003098	A	6	6	64565	64570	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_003098	TAA	2	6	64574	64579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_003098	A	6	6	64625	64630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_003098	AT	5	10	64634	64643	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_003098	TTCTAT	2	12	64660	64671	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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